在应用集成阶段，数字校园建设数字校园的建设备方面都得到了长足的发展，可以说此阶段是我国高校信
化发展的黄金时期。但是，此阶段也存在很多问题，存在如下一些普遍问题：
    ①在高校信息化过程中，重视实体对象(环境、资源)的数字化，忽视了过程对象(活动)的数字化。如管理信息化中重视公文管理、学籍管理、成绩管理、数字校园建设丁资管理等，教学信息化中重视多媒体教室建设、多媒体课件制作等，而对办事过程、教学活动、科研活动的支持相对较少；
    ②信息系统建设从整个数字空间的高度考虑不足，以局部建设为主。各高校的信息系统建设模式基本上都是一个部门一个系统，然后通过数据交换等手段进行数据共享，而很少从整个学校的高度根据业务的逻辑关系设计跨部门的系统，忽略了解决数字车间内部关联问题以及与现实校园的衔接问题；
    ③过于重视信息系统及其基础设施建设，数字校园建设而对活动的主体一  用户重视不够，考虑系统的运行效率多于用户的使用效率。此问题导致的后果是建设的信息系统越多，用户使用越麻烦，住至让用户在数字校园中也开始由于面对纷繁复杂的信息资源与服务而不加所措，出现信息化时代新的低效率问题。这些问题，就是新阶段我国简校信息化面临的挑战所在，数字校园建设也就是信息集成新阶段新一代数字校园着重要解决的问题。